Según el Decreto Ejecutivo No. 36499-S-MINAE, el Programa de Gestión Ambiental Institucional (PGAI) es un instrumento de planificación que guía a las instituciones a garantizar el cumplimiento de sus objetivos ambientales y promover un mejor desempeño ambiental en todas las instituciones públicas en todas sus sedes.
Como en todo sistema de gestión ambiental, se parte de un diagnóstico ambiental del quehacer institucional que considere todos los aspectos ambientales inherentes a la organización mediante un instrumento por aspecto ambiental facilitado por la Dirección de Gestión de Calidad Ambiental (DIGECA) del MINAE, incluyendo consumo de energía, residuos y aspectos relacionados al cambio climático, entre otros. A partir de este diagnóstico, se priorizan, establecen e implementan medidas de prevención, mitigación, compensación o restauración de los impactos ambientales, ya sea a corto, mediano o largo plazo.
Además del instrumento de diagnóstico, DIGECA facilita una serie de herramientas para el desarrollo de un Programa de Gestión Ambiental Institucional (PGAI), que puede tener acceso por medio de su web: PGAI | Digeca | Dirección de Gestión de Calidad Ambiental. Dentro de estas herramientas se encuentran protocolos para evaluar el manejo de los residuos sólidos, con una serie de criterios para verificar si se cumplen o no.